Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEBLO76041 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEBLO76041 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEBLO76041 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEBLO76041 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEBLO76041 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEBLO76041 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEBLO76041 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEBLO76041 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEBLO76041 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEBLO76041 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEBLO76041 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEBLO76041 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEBLO76041 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEBLO76041 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEBLO76041 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEBLO76041 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEBLO76041 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEBLO76041 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEBLO76041 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEBLO76041 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEBLO76041 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEBLO76041 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEBLO76041 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEBLO76041 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEBLO76041 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEBLO76041 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEBLO76041 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEBLO76041 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEBLO76041 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEBLO76041 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEBLO76041 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEBLO76041 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEBLO76041 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEBLO76041 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEBLO76041 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEBLO76041 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEBLO76041 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEBLO76041 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEBLO76041 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEBLO76041 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEBLO76041 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEBLO76041 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEBLO76041 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEBLO76041 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEBLO76041 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEBLO76041 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEBLO76041 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEBLO76041 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEBLO76041 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEBLO76041 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEBLO76041 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEBLO76041 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEBLO76041 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEBLO76041 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEBLO76041 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEBLO76041 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEBLO76041 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEBLO76041 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEBLO76041 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEBLO76041 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms