Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM4O75871 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM4O75871 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CEACAM4O75871 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM4O75871 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms