Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH16O75309 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH16O75309 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH16O75309 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH16O75309 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH16O75309 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH16O75309 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH16O75309 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH16O75309 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH16O75309 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH16O75309 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH16O75309 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH16O75309 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH16O75309 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH16O75309 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH16O75309 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH16O75309 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH16O75309 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH16O75309 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH16O75309 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH16O75309 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH16O75309 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH16O75309 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH16O75309 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH16O75309 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH16O75309 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH16O75309 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH16O75309 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH16O75309 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH16O75309 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH16O75309 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH16O75309 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH16O75309 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH16O75309 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH16O75309 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH16O75309 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH16O75309 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH16O75309 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH16O75309 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH16O75309 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms