Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MITFO75030 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MITFO75030 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MITFO75030 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MITFO75030 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MITFO75030 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MITFO75030 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MITFO75030 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MITFO75030 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MITFO75030 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MITFO75030 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MITFO75030 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MITFO75030 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MITFO75030 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MITFO75030 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MITFO75030 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MITFO75030 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MITFO75030 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MITFO75030 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MITFO75030 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MITFO75030 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MITFO75030 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MITFO75030 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MITFO75030 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MITFO75030 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MITFO75030 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MITFO75030 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MITFO75030 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MITFO75030 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MITFO75030 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MITFO75030 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MITFO75030 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MITFO75030 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MITFO75030 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MITFO75030 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MITFO75030 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MITFO75030 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MITFO75030 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MITFO75030 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MITFO75030 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MITFO75030 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MITFO75030 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MITFO75030 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MITFO75030 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MITFO75030 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MITFO75030 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MITFO75030 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MITFO75030 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MITFO75030 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MITFO75030 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MITFO75030 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MITFO75030 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MITFO75030 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MITFO75030 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MITFO75030 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MITFO75030 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MITFO75030 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MITFO75030 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MITFO75030 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MITFO75030 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MITFO75030 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MITFO75030 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MITFO75030 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MITFO75030 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MITFO75030 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MITFO75030 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms