Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PFDN1O60925 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN1O60925 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN1O60925 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN1O60925 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms