Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD6O60522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD6O60522 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD6O60522 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD6O60522 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms