Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC3O15379 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC3O15379 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC3O15379 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms