Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHADO15335 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHADO15335 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHADO15335 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHADO15335 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHADO15335 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHADO15335 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHADO15335 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHADO15335 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHADO15335 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHADO15335 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHADO15335 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHADO15335 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHADO15335 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHADO15335 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHADO15335 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHADO15335 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHADO15335 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHADO15335 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHADO15335 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHADO15335 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHADO15335 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHADO15335 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHADO15335 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHADO15335 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHADO15335 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHADO15335 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHADO15335 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHADO15335 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHADO15335 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHADO15335 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHADO15335 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHADO15335 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHADO15335 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHADO15335 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHADO15335 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHADO15335 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHADO15335 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHADO15335 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHADO15335 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHADO15335 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHADO15335 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHADO15335 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHADO15335 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHADO15335 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHADO15335 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHADO15335 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHADO15335 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHADO15335 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms