Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACOX3O15254 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACOX3O15254 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACOX3O15254 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOX3O15254 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms