Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIN7AO14910 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN7AO14910 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN7AO14910 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN7AO14910 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms