Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCSO14618 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCSO14618 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSO14618 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSO14618 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSO14618 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSO14618 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSO14618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSO14618 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSO14618 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCSO14618 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSO14618 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSO14618 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSO14618 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSO14618 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSO14618 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSO14618 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSO14618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSO14618 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSO14618 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSO14618 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSO14618 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCSO14618 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSO14618 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSO14618 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSO14618 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSO14618 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSO14618 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSO14618 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSO14618 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSO14618 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSO14618 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSO14618 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms