Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2CO00762 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2CO00762 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms