Protein–RNA interactions for Protein: O00244

ATOX1, Copper transport protein ATOX1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOX1O00244 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOX1O00244 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATOX1O00244 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms