Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H3BQV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
H3BQV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H3BQV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BQV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
H3BQV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
H3BQV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
H3BQV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
H3BQV1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
H3BQV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
H3BQV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
H3BQV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H3BQV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BQV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H3BQV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H3BQV1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H3BQV1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H3BQV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BQV1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BQV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BQV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BQV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BQV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H3BQV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
H3BQV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H3BQV1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQV1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BQV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H3BQV1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H3BQV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H3BQV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
H3BQV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BQV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BQV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BQV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BQV1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
H3BQV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H3BQV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H3BQV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H3BQV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BQV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BQV1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BQV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BQV1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BQV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BQV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BQV1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H3BQV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms