Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BNC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BNC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BNC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BNC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BNC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BNC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BNC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BNC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
H3BNC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BNC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BNC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BNC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BNC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BNC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BNC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BNC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BNC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BNC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BNC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BNC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BNC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BNC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BNC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BNC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BNC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BNC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BNC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BNC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BNC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BNC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BNC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BNC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BNC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BNC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BNC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BNC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BNC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BNC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BNC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BNC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BNC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BNC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BNC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BNC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BNC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BNC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BNC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BNC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
H3BNC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BNC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BNC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BNC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BNC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms