Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F8W8V4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8W8V4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8W8V4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8W8V4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8W8V4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
F8W8V4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8W8V4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8W8V4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8W8V4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
F8W8V4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F8W8V4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
F8W8V4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F8W8V4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
F8W8V4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
F8W8V4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8W8V4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8W8V4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F8W8V4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8W8V4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8W8V4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8W8V4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F8W8V4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
F8W8V4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8W8V4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8W8V4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8W8V4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F8W8V4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F8W8V4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8W8V4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8W8V4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
F8W8V4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F8W8V4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
F8W8V4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F8W8V4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F8W8V4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8W8V4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8W8V4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8W8V4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F8W8V4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8W8V4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8W8V4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8W8V4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F8W8V4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F8W8V4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F8W8V4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F8W8V4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms