Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf58C9J3I9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf58C9J3I9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf58C9J3I9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms