Protein–RNA interactions for Protein: B9A039

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9A039 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B9A039 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B9A039 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B9A039 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B9A039 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B9A039 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B9A039 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B9A039 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B9A039 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B9A039 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B9A039 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B9A039 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B9A039 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B9A039 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B9A039 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B9A039 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B9A039 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
B9A039 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
B9A039 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B9A039 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B9A039 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B9A039 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B9A039 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B9A039 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B9A039 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B9A039 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B9A039 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B9A039 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B9A039 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B9A039 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B9A039 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B9A039 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B9A039 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B9A039 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B9A039 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B9A039 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B9A039 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B9A039 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B9A039 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B9A039 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B9A039 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B9A039 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B9A039 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B9A039 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B9A039 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B9A039 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B9A039 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B9A039 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B9A039 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B9A039 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B9A039 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B9A039 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B9A039 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B9A039 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B9A039 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B9A039 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B9A039 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B9A039 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
B9A039 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B9A039 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B9A039 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms