Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBY3A6NI87 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBY3A6NI87 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms