Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX3A6NHT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMX3A6NHT5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMX3A6NHT5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms