Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1LA6NFU8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGPEP1LA6NFU8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1LA6NFU8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms