Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM30A4D0T7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM30A4D0T7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM30A4D0T7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM30A4D0T7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms