Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRGMA1A4Y4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRGMA1A4Y4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms