Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TRBV5-5A0A0J9YX44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TRBV5-5A0A0J9YX44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-5A0A0J9YX44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-5A0A0J9YX44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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