Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms