Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 VIRMA-204ENST00000519001 460 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SENP6-208ENST00000483859 1013 ntTSL 35.71□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-209ENST00000510372 1412 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SENP6-203ENST00000424947 2685 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-209ENST00000456975 2208 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-205ENST00000567693 2348 ntTSL 24.29□□□□□ -1.722e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.842e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 210.96□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 28.66□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 28.46□□□□□ -1.063e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58□□□□□ -1.133e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 37.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.383e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.544e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 34.35□□□□□ -1.714e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 211.17□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SYF2-203ENST00000474160 438 ntTSL 219.26■□□□□ 0.678e-18■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 MDN1-203ENST00000468568 538 ntTSL 33.91□□□□□ -1.786e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-211ENST00000582208 625 ntTSL 310.57□□□□□ -0.721e-12■□□□□ 8.8
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PUM1Q14671 WSB1-210ENST00000581440 943 ntTSL 310.28□□□□□ -0.761e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-205ENST00000487603 1898 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.93e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.983e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.071e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 27.69□□□□□ -1.183e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 25.64□□□□□ -1.513e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-212ENST00000583096 834 ntTSL 35.35□□□□□ -1.551e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.61□□□□□ -1.831e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 DOT1L-206ENST00000482433 3658 ntTSL 211.61□□□□□ -0.556e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CSDE1-210ENST00000525878 626 ntTSL 46.99□□□□□ -1.296e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CSDE1-211ENST00000525970 503 ntTSL 46.08□□□□□ -1.446e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 NAA15-207ENST00000496716 677 ntTSL 37.04□□□□□ -1.285e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 520.69■□□□□ 0.92e-30■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-30■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 513.95□□□□□ -0.188e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 EIF1-206ENST00000586699 572 ntTSL 25.41□□□□□ -1.544e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 219.34■□□□□ 0.697e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.039e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-212ENST00000497793 1228 ntTSL 221.07■□□□□ 0.968e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-211ENST00000495568 901 ntTSL 210.65□□□□□ -0.78e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-204ENST00000466823 584 ntTSL 28.88□□□□□ -0.998e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.38□□□□□ -0.752e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.761e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PRRC2C-209ENST00000480806 299 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.037e-14■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-219ENST00000532780 1194 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-210ENST00000527387 579 ntTSL 415.14■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-206ENST00000525624 1048 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 46.64□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-205ENST00000525463 583 ntTSL 54.57□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-223ENST00000534567 588 ntTSL 44.38□□□□□ -1.712e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 217.3■□□□□ 0.361e-44■□□□□ 8.8
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