Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U3KQV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQV3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U3KQV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U3KQV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U3KQV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U3KQV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQV3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U3KQV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U3KQV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U3KQV3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQV3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms