Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PMF1-BGLAPU3KQ54 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1-BGLAPU3KQ54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1-BGLAPU3KQ54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMF1-BGLAPU3KQ54 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms