Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANGPTL3Q9Y5C1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANGPTL3Q9Y5C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANGPTL3Q9Y5C1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANGPTL3Q9Y5C1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANGPTL3Q9Y5C1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms