Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms