Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIK3Q9Y2K2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK3Q9Y2K2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIK3Q9Y2K2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms