Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCE1Q9Y256 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCE1Q9Y256 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCE1Q9Y256 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms