Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HPSEQ9Y251 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPSEQ9Y251 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
HPSEQ9Y251 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms