Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNEQ9Y223 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNEQ9Y223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GNEQ9Y223 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNEQ9Y223 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms