Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SORCS3Q9UPU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SORCS3Q9UPU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SORCS3Q9UPU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms