Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF19Q9UMS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRPF19Q9UMS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF19Q9UMS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms