Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA11Q9UKX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGA11Q9UKX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA11Q9UKX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms