Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA2Q9UJY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GGA2Q9UJY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA2Q9UJY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA2Q9UJY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA2Q9UJY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms