Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM8Q9UJA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM8Q9UJA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms