Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTNAP2Q9UHC6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP2Q9UHC6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms