Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXTL2Q9UBQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXTL2Q9UBQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXTL2Q9UBQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms