Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGC1AQ9UBK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARGC1AQ9UBK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms