Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMOD3Q9NYL9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TMOD3Q9NYL9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TMOD3Q9NYL9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
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TMOD3Q9NYL9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMOD3Q9NYL9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
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