Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRMT1Q9NXH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRMT1Q9NXH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms