Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED29Q9NX70 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED29Q9NX70 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms