Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf42Q9NWW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf42Q9NWW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2orf42Q9NWW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf42Q9NWW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms