Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO6Q9NRD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO6Q9NRD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms