Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF4Q9NR80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF4Q9NR80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF4Q9NR80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF4Q9NR80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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