Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS4Q9NQG7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS4Q9NQG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS4Q9NQG7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS4Q9NQG7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms