Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNB1IP1Q9NPC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms